Star Trek: Deep Space Nine Phần 2 kéo dài câu chuyện đầy kịch tính xoay quanh những chông gai của sự độc lập trở lại của Bajor. Hải quân Federation và Đài quan sát hành tinh Deep Space Nine, đặt dưới quyền chỉ huy của Thống soái Joseph Sisko, đang chứng kiến cuộc khai triển lần đầu tiên đầy biến động của Bajor. Sự lôi cuốn di sản tâm linh của Bajor xen lẫn ambisiton vươn mạnh mẽ lên tầm địa chính trị gặp nhiều khó khăn khi Sisko phải chèo lái một con thuyền chính trị đầy mâu thuẫn. Ngôi làng người Bajor đang tìm kiếm hòa bình sau thế kỷ bị áp bức, phải đối mặt với những xung đột nội bộ do các phe phái chính trị khác nhau tranh giành quyền lực. Sisko không chỉ phải lo lắng cho sự ổn định của Bajor, mà còn phải đương đầu với những bí ẩn nằm ẩn sâu trong Cầu nối Wormhole, một con đường dẫn đến vùng không gian đất nước xa lạ và ẩn chứa những sức mạnh chưa từng biết đến. Tin đồn về một nền văn minh cường thịnh hẻo lánh bên kia lỗ sâu ngày càng râm ran, những lời kể về tiến hóa xa xôi và bí mật kinh hoàng hứa hẹn những thử thách không tưởng cho đội ngũ của Sisko. Phần 2 của Star Trek: Deep Space Nine hứa hẹn sẽ đưa khán giả dấn thân sâu hơn vào thế giới phức tạp và đầy hấp dẫn của Bajor, nơi biên giới giữa hi vọng và hiểm nguy luôn liềm li di.
