Hồ Sơ Tuyệt Mật – Phần 9 tiếp tục dẫn dắt chúng ta vào thế giới bí mật và đầy rẫy nguy hiểm xoay quanh cuộc điều tra của Đặc vụ Fox Mulder. Trong phần phim mới này, sự hiện diện của Mulder chỉ càng khiến Scully và con trai William gặp nguy hiểm. Anh ta một lần lagi biến mất, một quyết định được thực hiện bởi chính bản thân anh. Đặc vụ Doggett, người kế nhiệm Mulder, cố gắng tìm anh để tiến hành điều tra chống lại Phó Giám đốc Kersh. Tuy nhiên, Scully và đặc vụ Skinner đã thuyết phục Doggett từ bỏ vụ án. Dù vậy, mối nguy hiểm vẫn rình rập William. Scully nhận ra con trai mình đang bị giáo phái tôn giáo săn đuổi và cô tìm đến Lone Gunmen để tìm kiếm sự trợ giúp. Ngay cả Lone Gunmen cũng không thể ngăn chặn được việc William bị bắt cóc, dồn Scully vào một thế khó phải đưa ra một quyết định đau đớn. Chính trong lúc bi kịch nhất, một tia hy vọng lóe lên khi tin tức về Mulder được tìm thấy, nhưng anh đang bị giam giữ trong quân đội vì tội giết một kẻ bất tử.Hồ Sơ Tuyệt Mật – Phần 9 hứa hẹn là một hành trình đầy hồi hộp và nghẹt thở, với những cú rúng động, những bí ẩn khó giải và lựa chọn đầy cam go của Scully.
